Horsens HK’s beste prestatie in de eredivisie was het bereiken van de zesde plaats in seizoenen 90/91, 02/03, 03/04 en 05/06. In 2004 won de club de Deense cup door in de finale Ikast-Bording met 1 punt verschil (23-22) te verslaan. Dit gaf Horsens HK toegang tot de EHF Cup Winners’ Cup. Op dit Europese podium wist de club de kwartfinale te bereiken, waarin werd verloren van het HongaarseCornexi Alcoa.