De Intertoto Cup was sinds 1967 een mogelijkheid voor ploegen om in de zomer te kunnen blijven voetballen. Deze editie van 1988 werd zoals gebruikelijk gehouden tijdens deze zomerstop. Er werden alleen groepswedstrijden georganiseerd, omdat het onhaalbaar bleek om nog knock-outronden te spelen na de zomerstop. Clubs hadden daarvoor een te druk programma en de UEFA had bepaald dat ploegen die al aan UEFA-toernooien zoals de twee edities van de Europa Cup meededen, niet mochten deelnemen aan andere toernooien.

Aan deze editie van het toernooi deden 44 ploegen mee, twaalf meer dan vorig jaar. Er waren elf groepen van vier teams en elk team speelde zes wedstrijden. Er deden vijf ploegen mee uit Denemarken, Oostenrijk en Zweden; vier uit Hongarije, Oost-Duitsland, Tsjecho-Slowakije, West-Duitsland en Zwitserland; twee uit Israël, Nederland, Polen en de SFR Joegoslavië en één uit Bulgarije.

Het Deense Ikast FS uit groep 7 haalde dit toernooi de hoogste score: elf punten en een doelsaldo van +18.

plaats	Club	Doelpunten	Punten
1.	Malmö FF	11 : 4	9
2.	Karl-Marx-Stadt	8 : 7	8
3.	Hannover 96	10 : 9	4
4.	FC Den Haag	7 : 16	3

plaats	Club	Doelpunten	Punten
1.	IFK Göteborg	10 : 7	8
2.	Sigma Olomouc	10 : 10	7
3.	Slavia Sofia	8 : 9	5
4.	FC Aarau	7 : 9	4

plaats	Club	Doelpunten	Punten
1.	Banik Ostrava	12 : 11	8
2.	Örgryte IS	13 : 9	7
3.	Brondby IF	10 : 10	6
4.	Chemie Halle	5 : 10	3

plaats	Club	Doelpunten	Punten
1.	Vienna	11 : 14	7
2.	TJ Rudá Hvězda Cheb	11 : 7	6
3.	Vejle BK	6 : 6	6
4.	Banyasz Tatabánya	7 : 8	5

plaats	Club	Doelpunten	Punten
1.	BSC Young Boys Bern	16 : 9	8
2.	DAC Dunajska Streda	12 : 8	7
3.	IFK Norrköping	8 : 13	5
4.	Szombathelyi Haladás	6 : 12	4

plaats	Club	Doelpunten	Punten
1.	FC Kaiserslautern	15 : 8	9
2.	Admira Wacker	12 : 7	7
3.	FC Luzern	11 : 10	7
4.	ŁKS Łódź	9 : 22	1

plaats	Club	Doelpunten	Punten
1.	Ikast FS	20 : 2	11
2.	Sturm Graz	13 : 10	7
3.	Beitar Jeruzalem	8 : 16	4
4.	Sjimsjon Tel Aviv	3 : 16	2

plaats	Club	Doelpunten	Punten
1.	FC Carl Zeiss Jena	8 : 11	7
2.	Rad Beograd	11 : 7	6
3.	Aarhus GF	10 : 9	6
4.	Tirol Innsbruck	10 : 12	5

plaats	Club	Doelpunten	Punten
1.	Grasshopper-Club	8 : 2	10
2.	Pécsi MSC	6 : 6	5
3.	Pogon Szczecin	3 : 4	5
4.	Östers IF	5 : 10	4

plaats	Club	Doelpunten	Punten
1.	Karlsruher SC	13 : 7	7
2.	Vojvodina Novi Sad	11 : 7	7
3.	MTK Boedapest	5 : 9	6
4.	Grazer AK	5 : 11	4

plaats	Club	Doelpunten	Punten
1.	Bayer Uerdingen	11 : 4	11
2.	OB Odense	16 : 10	7
3.	FC Magdeburg	9 : 15	4
4.	AZ'67	10 : 17	2

• Europacup I 1988/89
• Europacup II 1988/89
• UEFA Cup 1988/89
• (en) [1] voor alle uitslagen, door Pawel Mogielnicki (RSSSF)