Filipović speelde in Kroatië twee seizoenen bij Cibalia Vinkovci en één seizoen bij Inter Zaprešić. Op 21 augustus 2017 tekende hij een contract voor drie seizoenen plus optie op een extra jaar bij Sporting Lokeren. Op 26 augustus 2017 debuteerde hij in de Jupiler Pro League tegen KAS Eupen.[3] In zijn eerste seizoen bij Lokeren speelde de Kroaat 37 competitieduels.