Aelbrecht was van 2010 tot 2018 in de jeugdopleiding van PSV actief en was van 2018 tot 2020 assistent-trainer bij Fortuna Sittard.[1] In het seizoen 2021/22 was hij coördinator van de jeugdopleiding van PSV.
In juni 2022 werd hij hoofdtrainer van TOP Oss, waar hij zijn landgenoot Bob Peeters opvolgde.[2] Eind december 2022 werd hij ontslagen toen de club op een negentiende plaats in de Eerste divisie stond.[3] Enkele maanden later ging hij aan de slag bij Club Brugge: Aelbrecht ging bij Club NXT, het beloftenelftal van de club in Eerste klasse B, de doorgeschoven Hayk Milkon assisteren.[4]
Aelbrecht begon het seizoen 2023/24 als Talent Coach van Club Brugge.[5][6] In januari 2024 werd Aelbrecht na het vertrek van Rik De Mil naar KVC Westerlo doorgeschoven naar de functie van assistent van hoofdtrainer Ronny Deila.[6] Toen Deila een paar maanden later zijn ontslag kreeg, werd ook de samenwerking met Aelbrecht stopgezet.[7]
In juni 2024 keerde Aelbrecht terug naar Nederland, waar hij bij Willem II aan de slag ging als assistent van zijn landgenoot Peter Maes.[8] Onder leiding van Maes was Willem II in het seizoen daarvoor gepromoveerd naar de Eredivisie.[8]