Een bio-ingenieur (of Master in de Bio-ingenieurswetenschappen; vroeger landbouwkundig ingenieur genoemd) is een academisch gevormde ingenieur, afgestudeerd aan een van de faculteiten bio-ingenieurswetenschappen (Faculteit wetenschappen aan de Universiteit Antwerpen).

De nadruk ligt in de opleiding op de levende materie. De vier basiswetenschappen (biologie, fysica, chemie en wiskunde) worden geïntegreerd waardoor bio-ingenieurs bekendstaan als zeer polyvalent. Dit wordt vertaald in het Engels tot Bioscience Engineering.

De benaming bio-ingenieur vervangt sedert de beginjaren 1990 de vroegere titels landbouwkundig ingenieur en ingenieur voor de scheikunde en de landbouwindustrieën. Door het afnemend belang van de landbouw binnen het gevoerde onderzoek en de latere tewerkstelling van de afgestudeerden weerspiegelden deze titels de opleiding niet meer. Een bio-ingenieur mag de wettelijk beschermde titel ir. dragen.

Deze opleiding bestaat aan de universiteiten van Antwerpen, Gent, Leuven en Brussel. Een vergelijkbare opleiding bestaat ook in Wageningen. De vier Vlaamse universiteiten bieden de bacheloropleiding in de bio-ingenieurswetenschappen aan.

Masteropleiding	UGent[1]	KU Leuven[2]	VUB[3]	UA[4]
Agro- and Ecosystems Engineering		Ja
Bio-informatics	Ja	Ja
Biosysteemtechniek		Ja
Bos- en natuurbeheer	Ja
Cel- en genbiotechnologie	Ja	Ja	Ja
Chemie- en bioprocestechnologie	Ja		Ja
Chemie & voedingstechnologie
Katalytische technologie		Ja
Landbouwkunde	Ja	Ja
Land- en bosbeheer		Ja
Land, water en klimaat	Ja
Levensmiddelentechnologie		Ja
Levensmiddelenwetenschappen en voeding	Ja
Milieutechnologie	Ja	Ja
Sustainable Urban Bioscience Engineering[5]	Ja	Ja		Ja

Deze lijst geeft, in 2017, de masteropleidingen aan de respectievelijke universiteiten. Na het succesvol afronden van één van deze masteropleidingen behaalt men de titel van bio-ingenieur (ir.).

De afstudeerrichtingen Levensmiddelentechnologie aan de KU Leuven en Levensmiddelenwetenschappen en voeding aan de UGent verschillen enkel in naam. De opleiding is analoog.

Sinds 2023 bieden UAntwerpen (coördinator), UGent en KU Leuven gezamenlijk de Master of Bioscience Engineering: Sustainable Urban Bioscience Engineering aan.

• Faculteit Bio-ingenieurswetenschappen Gent
• Landbouwwetenschappen
• Koninklijke Vlaamse Ingenieursvereniging

Andere Vlaamse academische ingenieurs(titels):

• Burgerlijk ingenieur
• Handelsingenieur

Volgende richting wordt ook ingenieur genoemd, maar draagt de titel ing in plaats van ir bij bovenstaanden:

• Industrieel ingenieur

• Faculteit Bio-ingenieurswetenschappen, Katholieke Universiteit Leuven
• Departement Bio-ingenieurswetenschappen, Faculteit Wetenschappen, Universiteit Antwerpen
• Faculteit Bio-ingenieurswetenschappen, Universiteit Gent
• Faculteit Bio-ingenieurswetenschappen, Vrije Universiteit Brussel
• Wageningen