De marathon van Madrid 1990 werd gelopen op zondag 29 april 1990. Het was de dertiende editie van deze marathon.

De overwinning bij de mannen ging naar de Braziliaan Jose Cesar de Souza in 2:14.24. Hij verbeterde hiermee het parcoursrecord en bleef de nummer twee Vicente Anton uit Spanje een kleine halve minuut voor. Bij de vrouwen was de Spaanse Marina Prat het snelste en finishte in 2:37.14. Net als de eerste man verbeterde ook zij het parcoursrecord.

rang	naam	land	tijd
1	Jose Cesar de Souza	BRA	2:14.24
2	Vicente Anton	ESP	2:14.51
3	Ian Haggen	ENG	2:16.55
4	Enrique Cortinas	ESP	2:17.15
5	Wieslaw Dubiel	POL	2:20.08
6	Eduardo Alcaina	ESP	2:20.16
8	Diego Sanchez	ESP	2:20.30
9	Janusz Wojcik	POL	2:21.00
13	Ramiro Matamoros	ESP	2:23.19

rang	naam	land	tijd
1	Marina Prat	ESP	2:37.14
2	Rosa-Maria Talavera	ESP	2:41.09
3	Czeslawa Mentlewicz	POL	2:42.45
4	Anna Iskra	POL	2:42.55
5	Carmen Mingorance	ESP	2:43.01
6	Elena Cobos	ESP	2:45.30
7	Maria Lopez	ESP	2:48.41
8	Joaquina Casas	ESP	2:49.54
9	Consuelo Casanovas	ESP	2:50.24