De vlag van De Middelsékrite werd op 29 juli 1989 vastgesteld aan het Friese waterschap toegekend.^[1] Vanaf 2004 is de vlag niet langer als de vlag van deze waterschap in gebruik omdat het waterschap De Middelsékrite in de nieuwe gemeente Wetterskip Fryslân op is gegaan.

De beschrijving van de vlag is als volgt:

twee even lange verticale banen blauw-rood met over het gehele vlaggedeelte verlaagd, in de verhouding 4:1:1:1:1 twee witte golvende horizontale banen; in de broektop in het blauw een geel meerblad met de opening naar boven, het blad met een hoogte gelijk aan 1/3 van de hoogte van de vlag.

De vlag is gebaseerd op het wapen van deze waterschap.

• 
  Wapen van De Middelsékrite