De vlag van Krapina-Zagorje werd door het provinciebestuur van Krapina-Zagorje op 17 december 1999 in gebruik genomen.^[1] Het ontwerp is de winnende inzending van een ontwerpwedstrijd.

De vlag heeft een rode doek met twee smalle gele banen boven en onder (1:8:1) en het wapen in het midden, omlijnd met gele rand. Het rood van het wapen is iets lichter dan het rood van de vlag.^[2]

Het wapen bestaat uit een schild zonder versierselen, met op het schild drie zespuntige sterren boven een kasteelmuur, in geel en rood. Het wapen toont de gefortificeerde stad Krapina – de stadsmuur, een poort en vijf torens - en komt al voor op een zegel uit de 12de eeuw.