Dit is een lijst van musea in Amsterdam.

• Ajax Museum, in Amsterdam ArenA (Zuidoost)
• Allard Pierson Museum, archeologisch museum van de Universiteit van Amsterdam
• Amsterdam Dungeon
• Amsterdam Museum, voorheen (tot 2011): Amsterdams Historisch Museum (AHM)
• Amsterdamse Bos, Bezoekerscentrum (Amstelveen)
• Anne Frank Huis
• Appie Baantjer Museum
• ARCAM, Architectuur Centrum Amsterdam
• Artis, dierentuin en natuurhistorische collecties
• Beurs van Berlage
• Bibliotheca Philosophica Hermetica (Ritman Library), bijzondere oude boeken
• Bilderdijk museum, onderdeel van de Universiteitsbibliotheek van de Vrije Universiteit, bezoek op afspraak (Zuid)
• Bijbels Museum, in de Cromhouthuizen
• Bijzondere Collecties van de Universiteitsbibliotheek van Amsterdam (Oude Turfmarkt)
• Botanische tuin Zuidas
• Brilmuseum
• Computermuseum van de Universiteit van Amsterdam (alleen open op afspraak) (Oost)
• Diamant Museum (Diamond Museum) (Zuid)
• Electrische Museumtramlijn Amsterdam (Zuid)
• Embassy of the Free Mind
• Erotisch Museum, Oudezijds Achterburgwal
• EYE Film Instituut Nederland (Noord) (voorheen Filmmuseum)
• FOAM, Fotografiemuseum Amsterdam
• Het Grachtenhuis
• Greenbox Museum of Contemporary Art from Saudi Arabia
• H'ART Museum (de vroegere Hermitage Amsterdam)
• Hash Marihuana & Hemp Museum
• Heineken Experience (Zuid)
• Hermanusje van Alles
• Hollandsche Manege, met Het Levend Paardenmuseum (West)
• Hollandsche Schouwburg, oorlogsmonument
• Hortus Botanicus Amsterdam
• Huis Marseille, Museum voor Fotografie
• Imagine IC, beeldinstituut voor cultuur en migratie (Zuidoost)
• Joods Historisch Museum
• KattenKabinet
• Klederdracht Museum Amsterdam
• Werf 't Kromhout
• Kuiperijmuseum
• Luther Museum Amsterdam
• Madame Tussauds Amsterdam
• Max Euwe Centrum, schaakmuseum
• Micropia (onderdeel van dierentuin Artis)
• Modern Contemporary Museum Amsterdam (Moco)
• Molen van Sloten en Kuiperijmuseum (Nieuw-West)
• Multatuli-Museum
• Museum Amsterdam-Noord (Noord)
• Museum Van Loon
• Museumwoning Tuindorp Oostzaan (HATO) (Noord)
• Nationaal Holocaustmuseum
• Normaal Amsterdams Peil (NAP) bezoekerscentrum^[1]
• NEMO, science center, vroeger NINT
• Nieuwe Kerk
• Noorderkerk
• Nxt Museum museum voor mediakunst
• Museumhaven Amsterdam (Oosterdok)
• Ons' Lieve Heer op Solder, ook bekend als Museum Amstelkring
• Oude Kerk
• Outsider Art Museum
• Paleis op de Dam
• G. Perlee Draaiorgelmuseum (Jordaan)
• Geelvinck Pianola Museum (Westerstraat)
• Pijpenkabinet (Amsterdam Pipe Museum)
• Planetarium in Artis
• Rembrandthuis
• Rijksmuseum Amsterdam (Zuid)
• Rijksprentenkabinet gevestigd in het Rijksmuseum, apart te bezoeken (Zuid)
• Ripley's Believe It or Not!
• Scheepvaartmuseum, in 's Lands Zeemagazijn
• Museum Het Schip (West)
• Sexmuseum, 'de Venustempel' (Damrak)
• Stadsarchief Amsterdam, in De Bazel
• Stedelijk Museum (Zuid)
• Theo Thijssen Museum
• Tot Zover, Nederlands Uitvaart Museum, op De Nieuwe Ooster (Oost)
• Medieval Torture Museum (Damrak)
• Amsterdam Tulip Museum, Tulpenmuseum
• Van Eesterenmuseum (Nieuw-West)
• Van Gogh Museum (Zuid)
• Verzetsmuseum Amsterdam
• Museum Vrolik van het AMC Amsterdam (Zuidoost)
• Wereldmuseum Amsterdam (voorheen Tropenmuseum) (Oost)
• Witsenhuis (Oost)
• Willy Alberti-museum in het Grand Café Peter Batenburg (Max Euweplein)
• Huis Willet-Holthuysen
• Woonbootmuseum (Houseboat Museum), op een boot in de Prinsengracht
• Zuiderkerk

• Lijst van musea in Noord-Holland
• Amsterdamse Musea (OAM)
• Museumnacht Amsterdam
• Amsterdamse museumtrams
• Lijsten van Amsterdamse onderwerpen

• Musea & Galleries op iamsterdam.com
• Amsterdamse Musea op amsterdammusea.org
• Tentoonstellingen in Amsterdam, o.a. in de musea