Onder leiding van de Montenegrijnse bondscoach Dušan Drašković maakte Uquillas zijn debuut voor Ecuador op 19 juni1991 in de vriendschappelijke wedstrijd tegen Chili, die eindigde in een 2-1-overwinning voor Ecuador door treffers van Juan Carlos Garay en José Guerrero. Ook verdedigers en Patricio Hurtado en José Higinio Rivera maakten in die wedstrijd hun debuut voor de nationale ploeg. Uquillas viel in dat duel in voor Robert Burbano. Hij kwam tot een totaal van zes interlands (nul doelpunten).